溶酶體(溶酶體染色試劑)的功能有二：一是與食物泡融合，將細(xì)胞吞噬進(jìn)的食物或致病菌等大顆粒物質(zhì)消化成生物大分子，殘?jiān)ㄟ^(guò)胞吐作用排出細(xì)胞；二是在細(xì)胞分化過(guò)程中，某些衰老的細(xì)胞器和生物大分子等陷入溶酶體內(nèi)并被消化掉，這是機(jī)體自身更新組織的需要。
溶酶體(溶酶體染色試劑)的主要作用是消化作用，是細(xì)胞內(nèi)的消化器官，細(xì)胞自溶，防御以及對(duì)某些物質(zhì)的利用均與溶酶體的消化作用有關(guān)。
細(xì)胞內(nèi)消化：對(duì)高等動(dòng)物而言細(xì)胞的營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)主要來(lái)源于血液中的大分子物質(zhì)，而一些大分子物質(zhì)通過(guò)內(nèi)吞作用進(jìn)入細(xì)胞，如內(nèi)吞低密脂蛋白獲得膽固醇，對(duì)一些單細(xì)胞真核生物，溶酶體的消化作用就更為重要了。
細(xì)胞凋亡：個(gè)體發(fā)生過(guò)程中往往涉及組織或器官的改造或重建，如昆蟲(chóng)和蛙類(lèi)的變態(tài)發(fā)育等等。這一過(guò)程是在基因控制下實(shí)現(xiàn)的，稱(chēng)為程序性細(xì)胞死亡，注定要消除的細(xì)胞以出芽的形式形成凋亡小體，被巨噬細(xì)胞吞噬并消化。
自體吞噬：**細(xì)胞中無(wú)用的生物大分子，衰老的細(xì)胞器等，如許多生物大分子的半衰期只有幾小時(shí)至幾天，肝細(xì)胞中線粒體的平均壽命約10天左右。
防御作用：如吞噬細(xì)胞可吞入病原體，在溶酶體中將病原體殺死和降解。
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